Thời thơ ấu

Lee là con của ông John Lee - một DJ và bà Sara Cargill. Amy có một em trai tên là Robby và hai em gái tên Carrie và Lori. Lee còn có người em gái thứ ba đã mất năm 1987 khi mới 3 tuổi do chứng động kinh (một số nguồn cho rằng bệnh không rõ nguồn gốc).[3] Ca khúc Hello từ album Fallen được cô viết dành cho em gái đã mất. Giống như ca khúc Like You từ album The Open Door với ca từ: "I long to be like you, sis; Lie cold in the ground like you did,..." như gợi lại cái chết cô em gái mình và nỗi đau buồn.[4] Lee học chơi nhạc cổ điển bằng piano trong 9 năm. Gia đình cô đã chuyển đi rất nhiều nơi, trong đó có cả Florida và Illinois[5], nhưng cuối cùng cũng định cư ở Little Rock, Arkansas - nơi bắt nguồn của ban nhạc Evanescence. Cô tốt nghiệp học viện Pulaski năm 2000 và trong một thời gian ngắn học tại Đại học Middle Tennessee State. Lee tiết lộ rằng cô có gốc là Scotland và Anh.

Trong một cuộc phỏng vấn của AOL Music, Lee tiết lộ rằng những ca khúc đầu tiên cô viết là "Eternity of Remorse" và "A Single Tear". Ca khúc đầu được viết khi cô mới 11 tuổi và mong sẽ trở thành một nhà soạn nhạc cổ điển. Còn ca khúc thứ 2 là từ một bài tập khi cô học lớp 8.[6]

Hôn nhân

Lee tiết lộ trong chương trình MuchMusic's ngày 9 tháng 1 năm 2007 tập Live @ Much, cô đã đính hôn vào chiều hôm trước. Sau đó, cô xác nhận trên trang EvThreads.com là đã được cầu hôn bởi Josh Hartzler, một nhà trị liệu 29 tuổi và là một người bạn lâu năm[7]. Cô nói rõ trong một cuộc phỏng vấn rằng những ca khúc "Good Enough" và "Bring Me to Life" được gợi cảm hứng từ Josh[8]. Cặp đôi này đã cưới vào ngày 6/5/2007 và nghỉ tuần trăng mật gần Bahamas[9]. Tháng 7/2014, Amy Lee sinh con trai đầu Jack Lion Hartzler.[10][11]